Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLTPP55058 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.2 ms