Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms