Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TAF6P49848 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF6P49848 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF6P49848 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms