Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPAP49450 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPAP49450 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPAP49450 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms