Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms