Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTRNP46939 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTRNP46939 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTRNP46939 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms