Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms