Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGIRP43119 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTGIRP43119 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms