Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms