Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms