Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms