Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA10P31260 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms