Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms