Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GIFP27352 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIFP27352 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIFP27352 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms