Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1P21675 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF1P21675 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1P21675 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms