Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms