Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms