Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBSLP0DN79 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms