Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NMBP08949 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NMBP08949 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMBP08949 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMBP08949 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMBP08949 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NMBP08949 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NMBP08949 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NMBP08949 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms