Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPBP07199 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms