Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCELO95171 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCELO95171 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCELO95171 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCELO95171 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms