Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms