Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNSO60931 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNSO60931 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNSO60931 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms