Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms