Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms