Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHP1O15259 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms