Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms