Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM233B4DJY2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM233B4DJY2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms