Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms