Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms