Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms