Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB15Q9Y5E8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms