Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP3Q9Y446 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms