Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF608Q9ULD9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms