Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN11AQ9UI33 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms