Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms