Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms