Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms