Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms