Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARPBPQ9NWS1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms