Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms