Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms