Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTDSP1Q9GZU7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTDSP1Q9GZU7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTDSP1Q9GZU7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTDSP1Q9GZU7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CTDSP1Q9GZU7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTDSP1Q9GZU7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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