Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms