Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG6Q9BXT2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms