Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms