Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms