Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms