Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms