Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1AQ96P16 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms